在“双碳”目标背景下，清洁氢作为零碳、高效、可大规模存储的二次能源，是能源转型与工业脱碳关键方向。PEM电解槽因响应速度快、适配波动性可再生能源的特点，成为清洁氢制备的主流技术路线。当前清洁氢度氢成本偏高、影响因素复杂、区域差异显著，制约了产业规模化落地。为识别成本驱动机制，本文以PEM电解槽制氢为研究对象，选取内蒙古、青海、江苏、广东、上海5个典型地区2020—2024年面板数据，构建轻量型机器学习成本评估模型，以工业电价、电解槽单位投资、弃风弃光率、地方制氢补贴为输入特征，以单位度氢成本（LCOH）为预测目标，建立多元线性回归基准模型与随机森林增强模型，通过模型对比、特征重要性分析与区域场景化预测，解析清洁氢成本的影响规律与经济性潜力。结果表明，多元线性回归模型R2=0.99，精度良好；随机森林模型特征重要性排序显示，工业电价和电解槽投资为核心影响因素；2025年内蒙古场景预测成本为23.39元/kg，与实际公开项目成本趋势一致。研究可为清洁氢降本路线、政策制定、区域布局提供支撑与参考。